Hallo
KonterSchock! Schön das du so emsig mit dabei bist und dich für das Projekt so sehr interessierst!!
Auf deinem Screenshot oben siehst du, dass hinter CPU eine "7" steht und dahinter "Ready" - das ist nicht optimal, denn so faltet nur deine Grafikkarte, nicht aber deine CPU!
Das hat technische Gründe und liegt an der Stanford University, woran du auch nichts ändern kannst. Was du aber ändern kannst, ist, dass du die Zahl von 7 auf 6 verringerst. Das hat zur Folge, dass deine CPU nicht mit 7 Threads sondern "nur" mit 6 Threads faltet. [Du hast einen Prozessor mit 4 Kernen und durch HyperThreading werden diese physikalischen Kerne nochmals "aufgeteilt, sodass dir maximal 8 Threads zur Verfügung stünden.]
Um das umzustellen klickst du in dem Hauptfenster "FAHControl" oben links auf "Configure" > dann wählst du den dritten Reiter "Slots" aus > in der Liste klickst du doppelt auf "0 cpu" > im neuen Fenster änderst du die Zahl oben (müsste momentan bei dir auf "-1" stehen) auf 6. Danach noch auf OK und Save klicken und von nun an werden 6 Threads (also "drei CPU-Kerne") zum Proteinefalten genutzt.
Als nächstes kannst du kontrollieren, dass im Hauptfenster nicht mehr blau hinterlegt "Ready" sondern grün hinterlegt "Running" steht. Es wurde eine neue WorkUnit runtergeladen und deine CPU hat angefangen diese zu berechnen.
Generell zum Thema was hier gemacht wird:
Proteine sind Eiweiße und kommen überall in unserem Körper vor, wobei sie die aller verschiedensten Aufgaben erledigen.
Als erstes kannst du dir ein Protein als einfachen Faden vorstellen, der je nach Protein bzw. Aufgabe in der Körperzelle mal etwas länger, mal etwas kürzer ist. Wenn ich von diesem Faden rede, dann sind wir da schon in sehr kleinen Dimensionen angelangt: der Faden besteht selbst aus hunderten/tausenden... Aminosäuren und eine Aminosäure besteht aus wenigen, bis vielen Atomen:
Glycin ist die kleinste/einfachste Aminosäure,
Phenylalanin (kennt man von einigen Lebensmitteln (Softdrink/Kaugummi glaube ich - "Achtung, erhält eine Phenylalaninquelle") ist hingegen deutlich größer/komplexer! Diese Warnung steht dann übrigens dadrauf, weil es Menschen gibt, die diese Aminosäure nicht verstoffwechseln können, was zur Folge hat, dass sie im Körper akkumuliert, weil sie nicht abgebaut werden kann und das bringt gesundheitliche Probleme mitsich.
Warum jetzt
Folding at home? Am Anfang der Herstellung in der Zelle ist ein Protein wie gesagt nichts weiter als ein Faden = eine Aneinanderreihung von Aminosäuren. Dieser hat zu dem Zeitpunkt aber noch keinerlei Funktion im Körper, denn erst, wenn sich dieser Faden auf
EINE ganz bestimmte Art und Weise (chemische Wechselwirkungen zwischen den einzelnen Atomen der Aminosäuren) um sich selbst gewunden hat wie ein Faden Wolle, kann er seiner bestimmten Aufgabe im Körper nachgehen und arbeiten.
Wenn man jetzt
erstens bedenkt, dass es bei etwa 20 verschiedenen Aminosäuren im Körper millionen Kombinationen gibt, verschiedenste "Fäden" in unterschiedlichsten Längen Protein1=(AS1+AS15+AS9+AS6+...) |||Protein2=(AS5+AS13+AS5+AS8+...) zu erstellen, dann ist das schon eine verdammt große Vielfältigkeit!
Wenn man jetzt
zweites bedenkt, dass sich bei Protein1 (zusätzlich zu
erstens) nochmals hunderte/millionen verschiedene Kombinationsmöglichkeiten ergeben, wie sich sie einzelnen Aminosäuren (AS1+AS15+AS9+AS6+...) zu einander verhalten/aneinander anlagern = chemische Wechselwirkungen zwischen den einzelnen Atomen der Aminosäuren = Faltung, dann potenziert sich die Vielfältigkeit abermals um ein Vielfaches!!!!!!!!!!!!!
Was hat das jetzt mit Krankheit (Krebs/Alzheimer... whatever!) zu tun?
Viele Diese Krankheiten beruhen darauf, dass sich beim alltäglichen Ablauf (Stoffwechsel) in unseren Zellen Proteine falsch zusammenfalten, d.h. es stimmt vielleicht noch die Primärsequenz (also der Faden) des herzustellenden Proteins (AS1+AS15+AS9+AS6+...) aber nicht mehr das sich bspw. AS1 mit AS5 und AS13 mit AS8 zusammenlagern sollte (das wäre die
Primärsequenz eines Proteins, es gibt auch noch Sekundär, Tertiär, Quartärstruktur); wie gesagt, es gibt nur
eine einzig richtige Kombinationsmöglichkeit ! Stattdessen hat sich wohlmöglich AS1 mit AS15 oder AS6 zusammengelagert und zack, kann es schon sein, dass das ganze komplette verdammte Protein (welches aus zig hunderten/tausenden Aminosäuren bestehen kann!) für die Tonne ist, weil es seine Funktion in der Zelle nicht mehr erfüllen kann. Das tritt physiologischerweise in allen Zellen immer mal wieder auf und ist auch überhaupt nicht schlimm; dann wird das funktions untüchtige Protein halt wieder abgebaut und neu hergestellt. Wenn aber der Körper genrell die Fähigkeit verloren hat (sprich in allen Zellen (eines Organs) ein bestimmtes und ggf. wichtiges Protein herzustellen, dann kann das nun mal in einer ernsthaften Krankheit münden.
Was Krebs angeht könnte es z.B. so sein, dass eine Körperzelle entartet (anfängt sich unkontrolliert zu teilen) und dann irgendwann Krebs entsteht. Um das zu verhindern gibt es Zellen unseres Immunsystems, die diese sich unkontrolliert teilenden Zellen markieren und entweder selbst platt machen oder die außerkontrollegeratene Zelle tötet sich selbst (weil es ihr von einer anderen Zelle "gesagt" wurde). Damit diese Zellen untereinander kommunizieren (
Zelle1: Hey, ist bei dirt alles okay?
Zelle2: nee, ****, ich werde zur Krebszelle!
Zelle1: okay, dann musst du sterben! Ist besser für uns alle!!
Zelle2: na gut...
) sind unter anderem auch Proteine zuständig, die sich auf der Oberfläche der Zellen befinden. Passt ProteinXY@Zelle1 jetzt aber nicht mehr zu ProteinAB@Zelle2, können diese nicht mehr kommunizieren und die entartende Zelle wird ggf. nicht getötet....... Viel mit dieser Zell <-> Zell-Kommunikation haben auch
Zytokine zu tun und auch das sind wiederum Proteine. Wie gesagt:
überall im Körper sind Proteine, es gibt sau viele und es gibt nochmals übermäßig (fast unvorstellbar) viele Möglichkeiten das diese wegen ihrer falschen Faltung "kaputt" = funktionslos sind.
[Ende der Ansprache!
]
