µATX Versionen sind in erster Linie unten abgeschnittene Mainboard, daher bieten diese wenig PCI Anschlüsse. Zusätzlich sind bei einigen Modellen noch weniger Anschlüsse vorhanden (z.B. weniger USB, SATA,...). Allerdings sind i.d.R absolut ausreichend Anschlüsse vorhanden.
Das Extreme4-M ist sehr gut. Allerdings bietet das Pro4-M für dich wahrscheinlich die gleiche Leistung. Hauptunterschied ist, dass das Extreme4-M SLI unterstützt. Das hast du jedoch sicher nicht vor?
Dein gewähltes Gehäuse kenne ich nicht, daher kann ich zu den Lüftern nichts sagen.
Edit: Das Intertech hat keinen Lüfter verbaut. Empfehlenswert wäre vorne ein 120mm Lüfter und hinten ein 92mm Lüfter. Empfehlenswert sind z.B. Enermax T.B. Silence. Die kosten nicht viel und sind in den Größen verfügbar.