Nochmal HDD abklemmen, im BIOS die SATA-Abschlüsse auf AHCI umstellen, das BS neu installieren, dabei die SSD formatieren, alle Systemtreiber und Programme neu installieren, Updates installieren, die 100MB Partition auf der HDD löschen, Systempfade zur HDD wieder anpassen, fertig.
Irgendwas vergessen?