Ich vermute mal das der Fehler aufgetreten ist, weil du beide CPU Anschlüsse gleichzeitig benutzt hast.
Wobei du die wohl auch falschrum angeschlossen hast. Laut deiner Aussage die Pumpe mit 3-Pin Anschluss an den 4-Pin (PWM) und den Lüfter mit 4-Pin PWM Anschluss an den 3-Pin.
Wenn ich gleich noch die Zeit finde, schraub ich mal meinen HTPC auf und schau mal was passiert wenn man beide CPU-Fan Anschlüsse gleichzeitig nutzt. Da is zwar ein ASRock B75M Pro-3 drin, aber ich glaube ja nicht das sich die Lüftersteuerung so großartig unterscheidet.