Hast du schonmal auf Viren überprüft?
Wenn es ein paar Tage weg war nach dem neu aufsetzen, dann hört sich das stark danach an. Oder die Festplatte ist wirklich zugemüllt, was ich eher bezweifel. (Defragmentieren)
Falls es dir ein Trost ist, ich habe momentan auch schwerwigende probleme mit meinem neuen System, die in diese Richtung gehen.