Ja, das schon.
Jetzt bringst du mich in Verlegenheit.
Das versteckte Verzeichnis Boot ist bei mir nicht im Windows-Ordner, sondern im Hauptverzeichnis der Partition. Also praktisch "neben" dem Windows-Ordner. Aber es muss bleiben. Darin ist Bootstat.dat. Aber nicht nur da. Im Windows-Ordner ist wohl auch eine Version davon, aber darum musst du dich nicht kümmern, die kannst du mit dem Windows-Ordner von Vista löschen, wenn du Vista nicht behalten willst.
Im Hauptverzeichnis bootmgr ist das, was bei XP und Vorgängern ntldr war, muss auf jeden Fall bleiben.
Im Zweifelsfall immer behalten, was im Hauptverzeichnis liegt. Wenn es wichtige Dateien sind, lässt sich die Bedeutung immer ergooglen.
Also: Bei Vista-Verzicht kannst du alle Ordner löschen, bis eben auf Boot.
Kann allerdings sein, dass sich manches dem Löschen wiedersetzt. Halte ich sogar für sehr wahrscheinlich.
Dann musst du sie in "Besitz" nehmen und Vollzugriffsrechte vergeben.
Viel Erfolg!