Teil Betreibsystem, teils Software, gebe nur mal ein Beispiel:
Folding@Home --> hier werden die 8 Threads sauber genutzt und auch ausgelastet, der F@H Client kann aber keinen Unterschied zwichen Realen und Virtuellen Kernen machen.
Und ja du hast recht, sollte man wirklich mal eine Software haben (was ich nicht wirklich glaube) welche sehr schlecht mit HT umgeht kann man es im UEFI ausschalten, somit hat eine CPU mit HT/SMT gar keine Nachteile