Naja, Kabelmanagement ist so ein großes Wort.. es ist zumindest davon abzusehen die Stromleitungen einfach quer über die Grafikkarte zu legen.
Dein ursprüngliches Problem, also die FPS-Drops kommen wohl von einem Hitzestau im Gehäuse. Soviel war erstmal klar, da das Öffnen des Gehäusedeckels das Problem ja gelöst hatte..
Auf den Bildern erkennt man dann auch das genauere Warum+Wieso. Da fehlen Gehäuselüfter, die Grafikkarte verbraucht schon ordentlich Saft, d.h. gibt ordentlich Wärme ab, und besitzt keine Radial- sondern eine Axialbelüftung. Sprich die Wärme der Graka heitzt somit auch das Gehäuse auf, und irgendwann ist der Graka und/oder der CPU einfach zu warm.
Ich empfehle dir stetig aufzurüsten, damit fährt man am billigsten. Und die erste Investition sollte entweder gleich ein ganzes Gehäuse mit Lüftern drin, oder mindestens ein 120er Lüfter für die Rückseite werden. Ein besserer CPU-Kühler im Towerformat und Ausrichtung nach Gehäuserückseite wäre auch sinnvoll, auch wenns erstmal so in der Größe von Arctic's Freezer 13 ist.
Solange die Hardware dann rennt, ist ja alles in Ordnung. Auch das billig-Mainboard, von Overclocking würde ich doch dringend abraten, dafür ist die Stromversorgung zu mager.
Außerdem, ein gutes Netzteil ist der Grundbaustein eines jeden PC's. Du willst deine Hardware nicht mit China-Böllern quälen oder riskieren. Da gibts auch schon preiswerte Angebote, z.B. von Be Quiet oder Enermax. Mit 500W solltest du noch gut bedient sein.