Nun nach der Pfadangabe scheinst du mit dem Windows SMP zu folden was schonmal schlicht gesagt schlecht ist.
Kleines Beispiel wenn mein i7 unter Windows foldet kommt der auf ca. 5-5,5k in einer Linux-VM auf ca. 8,2-8,5k.
Was deine GPU betrifft das kannste ansich vergessen mit den 2 Klients laufen lassen vor allem wenn die schönen
511er berechnen musst die lasten die Karten schon aus. Optimal für 2 GPU Klienten sind die 353er , 472er und 1888er.
Was du auch machen kannst ist dem FahCore der für die GPU zuständig ist eine höhere Priorität geben im Taskmanager das muß aber jedesmal neu gemacht werden.
Was den Speicher angeht kannste ruhig immer das maximum zuweisen denn wenn du zuwenig Speicher zuweist bricht die Performance ein.