Es gibt einige Faktoren die den Leitungsverlust in Kabeln beeinflussen.
Länge, Querschnitt und Material sind bei dir die Wichtigsten. Querschnitt ist schon mal kaum vorhanden.
Jetzt verdrei- oder vierfachen wir mal die Länge! Kennst du noch aus'm Physikunterricht die Faustregel; 1m=1V? So einfach ist es nicht aber so einfach kann man es verstehen.
Noch mal kurz zu deinem Aufbau:
Du hast das Y-Kabel und an einem der Stecker hängst du eine fremde Stromquelle? Ist dir bewust, dass der Strom auch in's Board und somit direkt zum Controller geht? Ich wär da vorsichtiger.
Vielleicht findet sich ja hier ein Elektriker oder Elektroniker der seine, eine Unbedenklichkeit aussprechen kann!
Du kannst meines Erachtens aber einen zweiten USB Port für das Kabel nutzen, dafür ist es eigentlich gedacht.