Hallo liebe Gemeinde,
im Auftrag meiner besseren Hälfte möchte ich euch um etwas Input bitten. Der Fragebogen folgt der Form halber weiter unten. Aber hier schon mal der Hintergrund als Fließtext:
Für das Labor bzw. die Arbeitsgruppe, in der meine Partnerin arbeitet, wird eine professionelle Workstation benötigt, um wissenschaftliche Bildbearbeitung und -analyse von Lasermikroskop-Aufnahmen zu betreiben (inkl. dem Trainieren neuronaler Netzwerke für die Analyse). Benötigt wird sowohl Windows als auch Linux, auf physikalisch getrennten Laufwerken (M.2-SSDs). Hauptsächlich verwendete Software ist MorphographX und ImageJ/FIJI. Mindestens für MorphoGraphX wird CUDA-Unterstützung benötigt, es soll also eine NVidia-Karte rein. Die Tendenz geht zu einer 3090 (Ti). In einer anderen Workstation läuft eine RTX Quadro 4000, die anscheinend leider das zwingend notwendige PyTorch wohl nicht beherrscht. Das wäre also auch eine Bedingung.
CPU-mäßig wäre man wohl offen, hat aber gute Erfahrungen mit AMDs Threadripper gemacht. Leider kann wohl niemand genau sagen, wie viele Kerne/Threads tatsächlich benötigt werden. Das ist immer das Problem mit der sehr spezifisch und tw. Open-Source-entwickelten Wissenschaftssoftware. RAM sollte mindestens 128GB vorhanden sein, gerne mit Option auf Aufrüstung. RAM-Takt ist vermutlich weniger wichtig. Massenspeicher sollten nach Möglichkeit auch SSD sein, da große Datenmengen (diverse GB pro Bild/Stack) geladen und gespeichert werden müssen, wäre hier eine schnelle Anbindung wünschenswert. Gesamtmenge des Massenspeichers muss definitiv diverse TB sein (ich weiß, sehr genau). Aufgrund der zu erwartenden hohen Leistungsaufnahme und Abwärme von CPU und GPU muss natürlich ein entsprechend dimensioniertes Netzteil sowie ein Gehäuse mit guter Kühlung her.
Das preisliche Limit ist 20.000€, der Arbeitsgruppenleiter/Prof. sähe es aber natürlich gerne, wenn das Budget nicht ganz ausgeschöpft würde und das letztlich angeschaffte System 3-4 Jahre hält und im realistischen Rahmen noch Aufrüstmöglichkeiten bietet. Peripherie ist jetzt nicht unbedingt notwendig, vielleicht hat ja aber noch jemand eine Empfehlung für einen 27" Monitor mit für Bildbearbeitung möglichst guter Ergonomie (Blaulichtfilter und der ganze Stuff, den es bestimmt gibt), WQHD sollte reichen.
So, und nach diesem kleinen Roman der Fragebogen:
1.) Wo hakt es
-
2.) PC-Hardware
-
3.) Monitor
Empfehlung gewünscht für 27" WQHD für Bildbearbeitung (Ergonomie für lange Image Analysis Sessions wichtiger als Bildqualität)
4.) Anwendungszweck
Wissenschaftliche Bildbearbeitung und -analyse, Nutzung neuronaler Netze. Wichtigste Programme: ImageJ/FIJI und MorphographX
5.) Budget
Max. 20.000€ (weniger ist natürlich immer gern gesehen)
6.) Kaufzeitpunkt
Keine rasende Dringlichkeit, falls der Launch der RTX 4000er oder neuer Profi-GraKas, oder neuer HEDT/Workstation-CPUs in den nächsten ein, zwei Monaten zu erwarten ist, könnte man das durchaus abwarten.
7.) sonstige benötigte Komponenten und Wünsche
NVIDIA-GPU (CUDA zwingend benötigt), gewisse Upgrade-Möglichkeiten (mehr RAM, evtl. später stärkere CPU, wobei ich keine Ahnung habe ob das realistisch ist in diesem Hardware-Segment), PyTorch muss von der GPU beherrscht werden.
8.) Zusammenbau
Würde von der Uni gemacht
9.) Speicherplatz
möglichst schnell angebunden (Laden/Speichern großer Datenmengen, bspw. Bilder/Stacks mit jeweils diversen GB Größe), Menge nicht ganz klar - ich sage jetzt einfach mal pauschal Minimum 20 TB schnellstmöglicher SSD-Speicherplatz
Vielen herzlichen Dank im Voraus für eure Ideen und Vorschläge!
im Auftrag meiner besseren Hälfte möchte ich euch um etwas Input bitten. Der Fragebogen folgt der Form halber weiter unten. Aber hier schon mal der Hintergrund als Fließtext:
Für das Labor bzw. die Arbeitsgruppe, in der meine Partnerin arbeitet, wird eine professionelle Workstation benötigt, um wissenschaftliche Bildbearbeitung und -analyse von Lasermikroskop-Aufnahmen zu betreiben (inkl. dem Trainieren neuronaler Netzwerke für die Analyse). Benötigt wird sowohl Windows als auch Linux, auf physikalisch getrennten Laufwerken (M.2-SSDs). Hauptsächlich verwendete Software ist MorphographX und ImageJ/FIJI. Mindestens für MorphoGraphX wird CUDA-Unterstützung benötigt, es soll also eine NVidia-Karte rein. Die Tendenz geht zu einer 3090 (Ti). In einer anderen Workstation läuft eine RTX Quadro 4000, die anscheinend leider das zwingend notwendige PyTorch wohl nicht beherrscht. Das wäre also auch eine Bedingung.
CPU-mäßig wäre man wohl offen, hat aber gute Erfahrungen mit AMDs Threadripper gemacht. Leider kann wohl niemand genau sagen, wie viele Kerne/Threads tatsächlich benötigt werden. Das ist immer das Problem mit der sehr spezifisch und tw. Open-Source-entwickelten Wissenschaftssoftware. RAM sollte mindestens 128GB vorhanden sein, gerne mit Option auf Aufrüstung. RAM-Takt ist vermutlich weniger wichtig. Massenspeicher sollten nach Möglichkeit auch SSD sein, da große Datenmengen (diverse GB pro Bild/Stack) geladen und gespeichert werden müssen, wäre hier eine schnelle Anbindung wünschenswert. Gesamtmenge des Massenspeichers muss definitiv diverse TB sein (ich weiß, sehr genau). Aufgrund der zu erwartenden hohen Leistungsaufnahme und Abwärme von CPU und GPU muss natürlich ein entsprechend dimensioniertes Netzteil sowie ein Gehäuse mit guter Kühlung her.
Das preisliche Limit ist 20.000€, der Arbeitsgruppenleiter/Prof. sähe es aber natürlich gerne, wenn das Budget nicht ganz ausgeschöpft würde und das letztlich angeschaffte System 3-4 Jahre hält und im realistischen Rahmen noch Aufrüstmöglichkeiten bietet. Peripherie ist jetzt nicht unbedingt notwendig, vielleicht hat ja aber noch jemand eine Empfehlung für einen 27" Monitor mit für Bildbearbeitung möglichst guter Ergonomie (Blaulichtfilter und der ganze Stuff, den es bestimmt gibt), WQHD sollte reichen.
So, und nach diesem kleinen Roman der Fragebogen:
1.) Wo hakt es
-
2.) PC-Hardware
-
3.) Monitor
Empfehlung gewünscht für 27" WQHD für Bildbearbeitung (Ergonomie für lange Image Analysis Sessions wichtiger als Bildqualität)
4.) Anwendungszweck
Wissenschaftliche Bildbearbeitung und -analyse, Nutzung neuronaler Netze. Wichtigste Programme: ImageJ/FIJI und MorphographX
5.) Budget
Max. 20.000€ (weniger ist natürlich immer gern gesehen)
6.) Kaufzeitpunkt
Keine rasende Dringlichkeit, falls der Launch der RTX 4000er oder neuer Profi-GraKas, oder neuer HEDT/Workstation-CPUs in den nächsten ein, zwei Monaten zu erwarten ist, könnte man das durchaus abwarten.
7.) sonstige benötigte Komponenten und Wünsche
NVIDIA-GPU (CUDA zwingend benötigt), gewisse Upgrade-Möglichkeiten (mehr RAM, evtl. später stärkere CPU, wobei ich keine Ahnung habe ob das realistisch ist in diesem Hardware-Segment), PyTorch muss von der GPU beherrscht werden.
8.) Zusammenbau
Würde von der Uni gemacht
9.) Speicherplatz
möglichst schnell angebunden (Laden/Speichern großer Datenmengen, bspw. Bilder/Stacks mit jeweils diversen GB Größe), Menge nicht ganz klar - ich sage jetzt einfach mal pauschal Minimum 20 TB schnellstmöglicher SSD-Speicherplatz
Vielen herzlichen Dank im Voraus für eure Ideen und Vorschläge!
Zuletzt bearbeitet:
