Bei meinem Board ist es egal wo ich was einstecke.
Nur beim 2. SATA-Port kommt es ganz darauf an, ob die erste M.2 eine SATA oder PCIe ist, denn mit SATA wird dieser Port gesperrt. Der zweite M.2 Slot teilt sich die Anbindung mit dem 3. PCIe Slot, der auch über dem Chipsatz angebunden ist und ist eine M.2 eingesteckt, dann wird dieser Slot deaktiviert. Eine SATA würde im zweiten M.2 Steckplatz zwar mechanisch passen, aber nicht funktionieren, da dort nur PCIe M.2 SSDs funktionieren.
Aus diesem Grund ist das Handbuch sehr wichtig, weil sich je nach Board wieder alles ändern kann.