Ja, beim einschalten, drehen die Lüfter i.d.R. kurz voll auf. Auch wenn du im BIOS bist, und evtl. Energiesparfunktionen der Hardware nicht aktiv sind, können die evtl. lauter/schneller laufen.
Generell solltest du dort auch die Lüfter nach den Bedürfnissen einstellen... also ob möglichst leise, dafür aber ggf. höhere Temperaturen..usw.
Wenn ein OS installiert ist, und alle notwendigen Treiber.. sollte sich das im Desktopbetrieb dann leiser darstellen.