Warum so kompliziert.
So wie ich es verstanden habe, hat der PC als Systempartition die SSD mit Win7 drauf und die fragliche Festplatte hängt als sekundäre Platte im Rechner. Dann sollte es möglich sein, einfach im Explorer von Windows die ungewollten Verzeichnisse zu löschen. Win7 weiß nichts davon, daß auf dieser Platte Betriebssysteme installiert sind. Für Win7 sind das Verzeichnisse wie alle anderen.