Jede SSD/HDD, die Du neu einbaust, ist erst einmal komplett leer. Von daher kannst Du mit solchen Tools die Partitionen gefahrlos löschen, wenn Du danach neu installierst.
Dass danach alle Daten weg sind, ist wohl klar, ich gehe hier von einem neuen PC oder zumindest einem neuen Datenträger ohne aufhebenswerte Altdaten aus.
Win 10 legt in der Regel (wenn man die Automatik nutzt) 3 Partitionen an:
eine mit 50-100 MB, welche den (erweiterten) Bootloader enthält
eine mit 500 MB - 1 GB als "Wiederherstellungspartition" mit einem kleinen Win-Livesystem
eine mit dem Rest des Laufwerks für Windows selber.
Die ersten beiden sollte man m.M.n. nicht anfassen und sich mit der Platzverschwendung abfinden. Früher ging es auch ohne (der Bootloader muss also nicht so verschwenderisch sein) und ein Rettungssystem benötige ich nicht, dafür gibt es bei mir Backups.
Der Windows-Installer reagiert in Sachen Partitionierung anders, ob der Datenträger leer ist oder nicht.