[Info] Falten für Anfänger oder: Was ist Folding@Home?
Dieser Thread soll Neueinsteigern dazu dienen, möglichst schnell und ohne Probleme in die - ich gebe zu - manchmal komplizierte Welt des Proteinfaltens einzusteigen
Das wichtigste zuerst: Was machen wir hier eigentlich?
Das Folding@Home-Projekt
Folding@Home ist ein Distributed Computing Projekt für die Erforschung von Krankheiten. Das Projekt nutzt die Leerlauf-Ressourcen von tausenden PCs von Freiwilligen aus der ganzen Welt, welche die Folding-Software auf ihrem System installiert haben. Dieses Netzwerk bildet einen der schnellsten Supercomputer der Welt. Die Software simuliert die Proteinfaltung, das Computational Drug Design und andere Arten von Molekulardynamik. Ziel ist es, Mechanismen der Proteinfaltung zu bestimmen, welche bei der Faltung von Proteine in eine dreidimensionale Struktur verwendet werden. Gleichzeitig wird nach Ursachen für Falsch/Mis-Faltungen gesucht, um dadurch hervorgerufene Krankheiten begegnen zu können. Dieses ist von signifikanten akademischem Interesse, mit bedeutenden Auswirkungen auf die medizinische Grundlagenforschung. Seit Projektbeginn wurden bereits mehr als 139 Papers durch Folding@Home für folgende Krankheiten generiert:
Die Software Folding@Home wurde durch das Pande Laboratory entwickelt und wird unter der Leitung von Prof. Vijay Pande von der Stanford University in den USA betrieben. Es wird eine statistische Simulationsmethodik verwendet. Die Simulationen werden stückweise in Form von Workunits durchgeführt, welche der Projektteilnehmer von einem Server lädt, berechnet und das Ergebnis zurücksendet. Die Ergebnisse der WU`s werden im Anschluss zusammengefügt, aufbereitet und bilden ein Ergebnis. Für das Berechnen von WU`s erhält der ProjektteilnehmerPoints per Day(PPD), welche seinem eigenem oder einem Sammel-Account gutgeschrieben werden können. Die PPDs sind umso höher, je schneller eine WU berechnet und eine Ergebnis abgeliefert wird.
Systemvoraussetzungen
Gefaltet werden kann mit:
Folgende Betriebssysteme sind (offiziell) geeignet:
Wie kann man Falten
Die Clients in der Liste sind verlinkt und führen zu entsprechenden HowTo`s im Forum.
Weitere Informationen zum Thema bieten diese Links:
Vom Bumble: Herzlichen Dank an brooker für seine tolle Arbeit
Dieser Thread soll Neueinsteigern dazu dienen, möglichst schnell und ohne Probleme in die - ich gebe zu - manchmal komplizierte Welt des Proteinfaltens einzusteigen
Das wichtigste zuerst: Was machen wir hier eigentlich?
Das Folding@Home-Projekt
Folding@Home ist ein Distributed Computing Projekt für die Erforschung von Krankheiten. Das Projekt nutzt die Leerlauf-Ressourcen von tausenden PCs von Freiwilligen aus der ganzen Welt, welche die Folding-Software auf ihrem System installiert haben. Dieses Netzwerk bildet einen der schnellsten Supercomputer der Welt. Die Software simuliert die Proteinfaltung, das Computational Drug Design und andere Arten von Molekulardynamik. Ziel ist es, Mechanismen der Proteinfaltung zu bestimmen, welche bei der Faltung von Proteine in eine dreidimensionale Struktur verwendet werden. Gleichzeitig wird nach Ursachen für Falsch/Mis-Faltungen gesucht, um dadurch hervorgerufene Krankheiten begegnen zu können. Dieses ist von signifikanten akademischem Interesse, mit bedeutenden Auswirkungen auf die medizinische Grundlagenforschung. Seit Projektbeginn wurden bereits mehr als 139 Papers durch Folding@Home für folgende Krankheiten generiert:
- Krebs,
- Alzheimer,
- Huntington,
- Osteogenesis imperfecta (Glasknochenkrankheit)
- verschiedenste Viren
Die Software Folding@Home wurde durch das Pande Laboratory entwickelt und wird unter der Leitung von Prof. Vijay Pande von der Stanford University in den USA betrieben. Es wird eine statistische Simulationsmethodik verwendet. Die Simulationen werden stückweise in Form von Workunits durchgeführt, welche der Projektteilnehmer von einem Server lädt, berechnet und das Ergebnis zurücksendet. Die Ergebnisse der WU`s werden im Anschluss zusammengefügt, aufbereitet und bilden ein Ergebnis. Für das Berechnen von WU`s erhält der ProjektteilnehmerPoints per Day(PPD), welche seinem eigenem oder einem Sammel-Account gutgeschrieben werden können. Die PPDs sind umso höher, je schneller eine WU berechnet und eine Ergebnis abgeliefert wird.
Systemvoraussetzungen
Gefaltet werden kann mit:
- x86 kompatibler CPU
- Nvidia Geforce mit CUDA-Unterstützung, also ab 8xxx-Serie
- AMD ab Radeon HD2xxx
- iGPUs von x86 CPU, teilweise möglich
Folgende Betriebssysteme sind (offiziell) geeignet:
- Windows 7, 8, 10
- Linux
Wie kann man Falten
- FAH-Client für CPU mit mindestens 4 Threads
- FAH-Client für GPUs
Die Clients in der Liste sind verlinkt und führen zu entsprechenden HowTo`s im Forum.
Weitere Informationen zum Thema bieten diese Links:
- Wikipedia
- weitere gut verständliche Erklärungen von PCGH F@H-Membern Bumblebee, interessierter User und JayTea sowie nochmal JayTea
- auf offene Fragen wird in der Rumpelkammer des PCGH F@H-Teams kurzfristig eingegangen
- Folding@Home unterLINUX
Vom Bumble: Herzlichen Dank an brooker für seine tolle Arbeit
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